INGÉNIEUR-E EN BIOINFORMATIQUE ET NEUROSCIENCES - H/F

Description:

Dans le cadre des activités de recherche de l'équipe de Homaira NAWABI « Du développement à la réparation» de l'unité de rechercche Grenoble Instititut Neurosciences, le/la bioinformaticien(ne) participera à un projet visant à analyser et intégrer des données biologiques à haut débit (single nuclei RNA seq; analyses haut débits déjà publiés, données de protéomique) pour mieux comprendre les mécanismes biologiques mis en jeu lors de la formation de circuits neuronaux

Activités principales:

• Analyse de données biologiques: traitement, nettoyage et normalisation de données issues de cytométrie en flux et de plateformes protéomiques
• Intégration multi-omique: mise en oeuvre d'approches d'intégration de données hétérogènes (biologiques et cliniques).
• Analyse statistique et modélisation: analyses exploratoires, analyses multivariées,clustering, réduction de dimension, identification de signatures biologiques et découverte de biomarqueurs.
• Développement de pipelines reproductibles: création et maintenance de workflows d'analyse sous R/Python
• Interaction avec l'équipe: échanges réguliers avec biologistes, participation aux réunions de projet.
• Rédaction et communication scientifique: préparation de figures, rapports, documentation, contributions aux publications.
• Gestion des données: organisation, documentation et archivage des données selon les bonnes pratiques (FAIR, traçabilité).

Profil recherché:

FORMATION

• Diplôme de niveau BAC+5

CONNAISSANCES

• Maîtrise des concepts et méthodes en BIOINFORMATIQUE, BIOSTATISTIQUES et analyse de données omiques.
• Solides compétences en R ET/OU PYTHON (ou autre langage de programmation adapté à l'analyse de données).
• Expertise en TRANSCRIPTOMIQUE et/ou PROTÉOMIQUE, avec une bonne connaissance des deux domaines appréciée.
• Connaissance des approches et méthodes d'INTÉGRATION DE DONNÉES MULTI-OMIQUES.
• Bonne compréhension des principes de la BIOLOGIE DES SYSTÈMES; des connaissances en NEUROSCIENCES seraient un atout.
• Maîtrise des principes FAIR et des bonnes pratiques de gestion et de valorisation des données scientifiques.

COMPÉTENCES TECHNIQUES

• Analyser et interpréter des jeux de données biologiques complexes et volumineux.
• Développer, automatiser et documenter des pipelines d'analyse reproductibles.
• Mettre en œuvre des méthodes statistiques avancées adaptées aux données omiques.
• Produire des visualisations pertinentes et communiquer efficacement des résultats complexes.
• Rédiger des protocoles, rapports d'analyse, documentations techniques et publications scientifiques.

QUALITÉS ATTENDUES

• Rigueur scientifique et sens de la qualité.
• Esprit d'analyse et de synthèse.
• Autonomie et capacité à piloter des projets d'analyse de données.
• Aptitude à travailler au sein d'équipes pluridisciplinaires associant biologistes, cliniciens et data scientists.
• Excellentes qualités relationnelles et de communication, à l'écrit comme à l'oral.
• Sens de l'organisation, gestion des priorités et capacité d'adaptation.
• Force de proposition et aptitude à anticiper et résoudre les problématiques techniques ou scientifiques.

EXPÉRIENCE SOUHAITÉE

• Expérience significative en analyse de données omiques (transcriptomique, protéomique, cytométrie, etc.).
• Expérience en INTÉGRATION MULTI-OMIQUE ou en DATA SCIENCE APPLIQUÉE AUX SCIENCES BIOMÉDICALES.
• Expérience du travail dans un environnement de recherche académique ou en collaboration avec des équipes biologiques et/ou cliniques.
• Une expérience dans le domaine des NEUROSCIENCES