Ingénieur.e biologiste en analyse de données (H/F)

RESPONSABILITÉS:

Notre groupe a accès à des données cliniques et à plusieurs données omiques longitudinales (métabolome, protéome, microbiome, scRNA-sequencing) issues de deux grandes cohortes françaises de patients gravement malades. Les missions de l'ingénieur.e seront de:

• caractériser l'effet de la pneumonie et de complications (i.e. cardiovasculaires) sur chaque omique,
• réaliser une intégration multi-omique
• évaluer si les signatures identifiées, par exemple la reprogrammation métabolique ou lipidique, sont associées à des événements cardiovasculaires ultérieurs.
  Le/la candidat.e retenu.e sera chargé.e des analyses bio-informatiques du séquençage immunologique, de l'interprétation des analyses multi-omiques et de la rédaction d'un manuscrit.
  Activités principales
• Concevoir, Développer, déployer et maintenir des méthodes d'analyses de données omiques
• Analyser des données de métabolomique et protéomique
• Interagir avec les autres membres de l'équipe
  RETROUVEZ LA FICHE DE POSTE EN INTEGRALITE: https://www.univ-nantes.fr/universite/recrutement/nantes-universite-recrute-un-e-ingenieur-e-biologiste-en-analyse-de-donnees-cr2ti-3

PROFIL RECHERCHÉ:

• Versant: Fonction publique d'État
• Type de recrutement: Catégorie A, contractuel-le, CDD 14 mois (article L.332-24 du CGFP)
  Formation et/ou qualification:
  Un doctorat (ou qualification équivalente) suivi de 2 années minimum de post-doctorat en bio-informatique.
  Un diplôme supplémentaire en biologie serait un atout pour l'intégration translationnelle du projet.
  Un très bon niveau en langage de programmation (Python ou R) est attendu.
  Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste:
  Une expérience ayant permis l'acquisition d'un solide savoir-faire en bio-informatique (langages de programmation, modélisation statistique, analyse prédictive et intégration de données omiques (métabolome, protéome, microbiome, transcriptome), d'une bonne expertise en immunologie et la capacité à travailler en équipe multidisciplinaire est bienvenue.
  La publication d'articles dans des journaux scientifiques reconnus en tant que principal auteur sera appréciée.