Ingénieur d'étude hospitalier (H/F)

RESPONSABILITÉS:

Nous avons besoin d'un ingénieur de recherche afin d'analyse des données de single cell RNAseq/single nuclei RNAseq et de transcriptomique pour étudier l'hétérogénité tumorale de l'ostéosarcome (OS), une tumeur osseuse maligne rare. Votre mission ira de l'étape d'alignement des données jusqu'à l'identification cellulaire en collaboration avec l'équipe d'anatomopathologiste du CHU de Toulouse.
Activités génériques du métier

• Développer, tester et implémenter des pipelines d'analyse bio-informatique
• Effectuer des analyses computationnelles et statistiques en transcriptomique
• Mettre en forme les résultats en vue de publications et assurer la pérennité des outils et résultats à travers des outils de gestion de projet et de documentation adaptés
• Diffuser et valoriser les résultats et réalisations sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales, y compris en Anglais

PROFIL RECHERCHÉ:

Prérequis obligatoires:

• Diplôme de type Bac +5 dans le domaine de la bio-informatique.
• Maîtrise du travail sous linux en ligne de commande (bash)
• Maîtrise d'au moins un langage de script (ex. Python, R ou bash)
• Expérience en gestion de projet et documentation
• Exprérience en analyse transcriptomique
  Rejoindre le CHU de Toulouse c'est bénéficier:
• Un environnement de travail éco responsable et de qualité avec des facilités d'accès (crèches, transport en commun, parking).
• Une prise en charge de 75% des frais des abonnements Tisséo, Sncf et VélÔToulouse.
• Un CE/CGOS: prestations sociales, aides remboursables logement, CESU, chèques vacances, voyages, chèques culture.
• Un restaurant pour le personnel et des repas à emporter au tarif unique de 4,15 €
  Intégrer le CHU de Toulouse, c'est participer au quotidien à une offre de soins d'excellence et de proximité en réponse aux besoins de la population.